MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 11133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	T	6	6	25	30	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022777	A	6	6	31	36	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022777	TGT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022777	CAA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022777	AATTT	2	10	108	117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022777	TAT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022777	TATT	3	12	159	170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022777	TC	3	6	182	187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022777	GTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022777	TAATA	2	10	224	233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022777	TAT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022777	TAAT	2	8	2612	2619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022777	TTA	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022777	TTA	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022777	AATATA	2	12	2719	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022777	T	6	6	2744	2749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022777	AGG	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022777	AGG	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022777	TATT	2	8	4226	4233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022777	AGA	3	9	4251	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022777	A	8	8	4263	4270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022777	GAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022777	ATTA	2	8	4841	4848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022777	TTTA	2	8	4857	4864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022777	ATA	2	6	5421	5426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022777	TTAT	2	8	5437	5444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022777	ATT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022777	A	6	6	5497	5502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022777	AATT	2	8	5513	5520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022777	T	7	7	5529	5535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022777	AAT	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022777	AAT	2	6	5838	5843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022777	TCAG	2	8	5870	5877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022777	TGC	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022777	TCG	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022777	G	6	6	5967	5972	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022777	CTC	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022777	ACG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022777	CTA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022777	ACC	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_022777	CG	3	6	6420	6425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022777	AGG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022777	GGT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022777	AGCA	2	8	6698	6705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022777	GCC	2	6	6831	6836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_022777	CCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022777	TC	3	6	7078	7083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022777	ACCT	2	8	7087	7094	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022777	AGCTT	2	10	7194	7203	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022777	AC	3	6	7240	7245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022777	ACTC	2	8	7457	7464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022777	CTT	2	6	7480	7485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022777	CTC	2	6	7514	7519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_022777	GGT	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022777	GCT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022777	ACTTA	2	10	7677	7686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022777	GTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022777	TGT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022777	GAG	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022777	TCC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022777	CTCCC	2	10	8206	8215	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_022777	AGT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022777	G	6	6	8281	8286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022777	C	6	6	8291	8296	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_022777	T	6	6	8356	8361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022777	CT	3	6	8401	8406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022777	AAAT	2	8	8452	8459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022777	TCGC	2	8	8483	8490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022777	CTA	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022777	TCC	2	6	8522	8527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_022777	GCT	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022777	CACTT	2	10	8821	8830	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022777	TAC	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022777	TTA	2	6	8881	8886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022777	TC	3	6	8955	8960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022777	AGG	2	6	9004	9009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022777	GT	3	6	9145	9150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022777	GT	3	6	9314	9319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022777	ATG	2	6	9339	9344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022777	TCC	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_022777	CTG	2	6	9411	9416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022777	CTA	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022777	CACGA	2	10	9466	9475	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_022777	GAC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022777	CAC	2	6	9492	9497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_022777	TTC	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022777	GCT	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022777	CCT	2	6	9706	9711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_022777	TCC	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_022777	GCT	2	6	10020	10025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022777	ACA	2	6	10078	10083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022777	TCA	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022777	TGC	2	6	10124	10129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022777	CTG	2	6	10163	10168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022777	TCG	2	6	10238	10243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022777	TTACC	2	10	10257	10266	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_022777	TCC	2	6	10356	10361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_022777	CCG	2	6	10417	10422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_022777	GAAG	2	8	10437	10444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022777	CGC	2	6	10475	10480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022777	T	7	7	10572	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022777	TTTG	2	8	10633	10640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022777	T	8	8	10672	10679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022777	T	6	6	10694	10699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022777	ATTT	2	8	10703	10710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022777	GTT	2	6	10720	10725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022777	TC	3	6	10739	10744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022777	GAC	2	6	10745	10750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022777	TTC	2	6	10773	10778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022777	TAT	2	6	10799	10804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022777	GTT	3	9	10878	10886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022777	T	6	6	10919	10924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022777	ATT	3	9	10940	10948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022777	TA	4	8	10969	10976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022777	TA	4	8	10992	10999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022777	T	6	6	11006	11011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022777	ATT	2	6	11697	11702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022777	A	6	6	11737	11742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022777	ATC	2	6	11765	11770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022777	TTTTA	2	10	11811	11820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022777	AAATT	2	10	11824	11833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022777	AATTT	2	10	11863	11872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022777	ATCAA	2	10	11935	11944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022777	TGT	2	6	11982	11987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022777	TAT	2	6	11994	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022777	AT	3	6	12003	12008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022777	ATT	2	6	12025	12030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022777	TA	3	6	12041	12046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022777	TCC	2	6	12245	12250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_022777	CTT	2	6	12450	12455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022777	TAA	2	6	12466	12471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022777	TAT	2	6	12472	12477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022777	A	9	9	12502	12510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022777	TA	3	6	12520	12525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022777	TA	3	6	12529	12534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022777	CCT	2	6	12715	12720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_022777	TA	3	6	13533	13538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022777	TATT	2	8	13563	13570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022777	TA	3	6	13579	13584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022777	TTA	2	6	13588	13593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022777	AAATT	2	10	13604	13613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022777	T	7	7	13652	13658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022777	ATT	2	6	13661	13666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022777	ATT	2	6	13738	13743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022777	ATTAA	2	10	13746	13755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022777	TA	3	6	13788	13793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022777	TAATT	2	10	13844	13853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022777	GGA	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022777	AAT	2	6	15128	15133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022777	CT	3	6	15741	15746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022777	TTA	2	6	16492	16497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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